โดยปกติถุงน้ำรังไข่หรือซีสต์รังไข่มักฝ่อไปเอง จึงไม่ต้องผ่าตัดรักษา แต่ถุงน้ำบางประเภทก็ทำให้มีอาการปวดท้องรุนแรงได้ ซึ่งมักเกิดจากภาวะแทรกซ้อน เช่น ถุงน้ำแตก ถุงน้ำบิดขั้ว จึงจำเป็นต้องรีบผ่าตัดรักษา

ภาวะถุงน้ำรังไข่หลายใบ หรือ Polycystic Ovary Syndrome (PCOS) เป็นภาวะที่เกิดจากความผิดปกติของฮอร์โมนในเพศหญิง ส่งผลให้ในรังไข่แต่ละข้างจะมีฟองไข่หรือถุงน้ำมากกว่าปกติ